Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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GPNMBQ14956 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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GPNMBQ14956 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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GPNMBQ14956 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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GPNMBQ14956 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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GPNMBQ14956 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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GPNMBQ14956 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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GPNMBQ14956 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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