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| RUNX2 | Q13950 | AL163153.1-201 | ENST00000554223 | 283 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TGIF1P1-201 | ENST00000558095 | 802 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCLAF-207 | ENST00000559519 | 749 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009145.1-201 | ENST00000563230 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01290-201 | ENST00000566787 | 502 nt | TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006557.5-201 | ENST00000603126 | 811 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL035413.2-201 | ENST00000604801 | 525 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | FTX_3.1-201 | ENST00000610451 | 147 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | IBTK-209 | ENST00000510291 | 4109 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ABCA5-208 | ENST00000588877 | 6525 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C12orf4-201 | ENST00000261250 | 3826 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100800.1-201 | ENST00000524252 | 2054 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | METTL18-201 | ENST00000303469 | 1426 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RIOK3P1-201 | ENST00000418778 | 1528 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007256.1-201 | ENST00000392253 | 2765 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF826P-207 | ENST00000622273 | 1910 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR4M1-202 | ENST00000641200 | 3493 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1287P-201 | ENST00000362914 | 107 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | SKP1-203 | ENST00000517625 | 876 nt | APPRIS P4 TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UTP23-205 | ENST00000520733 | 369 nt | TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC021739.4-201 | ENST00000561417 | 569 nt | TSL 4 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC234778.2-201 | ENST00000566241 | 354 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | RDM1-219 | ENST00000615378 | 542 nt | TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEPT14P19-202 | ENST00000632397 | 370 nt | TSL 3 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024614.3-201 | ENST00000637860 | 256 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC233263.6-201 | ENST00000631132 | 1963 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NBEAL1-203 | ENST00000449802 | 10938 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FOXP2-224 | ENST00000635534 | 4290 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZFYVE16-202 | ENST00000505560 | 6599 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SLC5A3-201 | ENST00000381151 | 11576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | YWHAZ-211 | ENST00000457309 | 3007 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FOXP2-206 | ENST00000393491 | 6085 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ASNSP3-201 | ENST00000451989 | 1306 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | JMJD1C-210 | ENST00000542921 | 8149 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNMT-206 | ENST00000589866 | 1879 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELF1-201 | ENST00000239882 | 3566 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ERBIN-201 | ENST00000284037 | 8647 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2W-203 | ENST00000517608 | 8426 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MBNL1-206 | ENST00000357472 | 5256 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MAPK10-266 | ENST00000641066 | 6555 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FTLP6-201 | ENST00000355274 | 422 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP387-201 | ENST00000364226 | 106 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-33P-201 | ENST00000364249 | 162 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.333-201 | ENST00000365274 | 102 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | MS4A4E-202 | ENST00000398986 | 522 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-46P-201 | ENST00000410818 | 138 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | OR9R1P-201 | ENST00000412200 | 877 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL109924.3-201 | ENST00000413324 | 393 nt | TSL 2 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC126124.2-201 | ENST00000413542 | 321 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL078645.1-201 | ENST00000414377 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356968.1-201 | ENST00000416622 | 474 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPEP10-201 | ENST00000420249 | 274 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136322.1-201 | ENST00000422250 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL137789.1-201 | ENST00000439443 | 682 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB3P11-201 | ENST00000440127 | 604 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004801.2-202 | ENST00000463559 | 283 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P8-201 | ENST00000465083 | 535 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC34P1-201 | ENST00000507441 | 517 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023200.1-201 | ENST00000519660 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005476.1-201 | ENST00000554427 | 397 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133241.1-201 | ENST00000556832 | 487 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC233702.6-201 | ENST00000584594 | 396 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001972.3-202 | ENST00000603012 | 375 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BNIP3P9-201 | ENST00000603714 | 553 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079610.3-201 | ENST00000606960 | 147 nt | TSL 3 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099778.2-201 | ENST00000610904 | 211 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SMAD5-AS1_2.1-201 | ENST00000617906 | 131 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR7975-201 | ENST00000619350 | 68 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01002-215 | ENST00000632203 | 314 nt | TSL 5 BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |