Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RUNX2Q13950 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms