Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RPA4Q13156 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms