Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CSTF3Q12996 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CSTF3Q12996 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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