Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SH3BP1Q9Y3L3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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SH3BP1Q9Y3L3 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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SH3BP1Q9Y3L3 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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SH3BP1Q9Y3L3 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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