Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SPHK1Q9NYA1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms