Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
LHX9Q9NQ69 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LHX9Q9NQ69 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms