Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms