Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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ZBED3Q96IU2 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ZBED3Q96IU2 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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