Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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SMC1AQ14683 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SMC1AQ14683 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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