Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITGA9Q13797 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms