Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CUL4AQ13619 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CUL4AQ13619 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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