Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CUL1Q13616 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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CUL1Q13616 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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CUL1Q13616 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CUL1Q13616 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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