Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNTN1Q12860 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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