| CNTN1 | Q12860 | C1orf112-206 | ENST00000472795 | 925 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC117460.1-201 | ENST00000508964 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU7-51P-201 | ENST00000516560 | 62 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP471-201 | ENST00000516971 | 106 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-56P-201 | ENST00000516986 | 93 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP290-201 | ENST00000517133 | 127 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP000873.5-201 | ENST00000533906 | 236 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC068135.2-201 | ENST00000569293 | 1028 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC040904.1-201 | ENST00000590850 | 223 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | GLUD1P4-201 | ENST00000590914 | 418 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RSL24D1P11-201 | ENST00000591045 | 491 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL358072.1-201 | ENST00000604156 | 575 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007363.1-201 | ENST00000604736 | 620 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC004908.3-201 | ENST00000610248 | 625 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL133173.2-201 | ENST00000614270 | 90 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | C4orf22-209 | ENST00000621014 | 228 nt | TSL 3 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL589994.2-201 | ENST00000621124 | 579 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC073308.1-201 | ENST00000623696 | 305 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL390237.1-201 | ENST00000404226 | 1415 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC010680.1-201 | ENST00000590024 | 3590 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL161431.1-201 | ENST00000618966 | 4205 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CHD9-218 | ENST00000566029 | 13110 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CR848007.1-201 | ENST00000442354 | 1699 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL137003.2-201 | ENST00000606924 | 2538 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZNF334-205 | ENST00000615481 | 3706 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | TANK-201 | ENST00000259075 | 2152 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR26A1-201 | ENST00000362205 | 77 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA20.2-201 | ENST00000383922 | 131 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-39P-201 | ENST00000384344 | 107 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL21P75-201 | ENST00000396599 | 483 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPS3AP36-201 | ENST00000398190 | 775 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL21P28-201 | ENST00000401418 | 483 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL356057.3-201 | ENST00000402607 | 340 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL592114.1-201 | ENST00000403842 | 483 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC105271.1-202 | ENST00000411417 | 445 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL365356.1-201 | ENST00000411512 | 736 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC000123.1-201 | ENST00000418215 | 516 nt | TSL 5 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC099548.1-201 | ENST00000421443 | 426 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL356277.3-201 | ENST00000432484 | 618 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC112220.1-201 | ENST00000434628 | 355 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC112518.1-201 | ENST00000436089 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | U91324.1-201 | ENST00000442864 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC244505.5-201 | ENST00000443639 | 207 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LAMTOR5P1-201 | ENST00000444290 | 270 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LINC01758-201 | ENST00000448001 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC013269.3-201 | ENST00000450486 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTND1P27-201 | ENST00000451117 | 902 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL21P39-201 | ENST00000463605 | 483 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC126389.1-201 | ENST00000477436 | 290 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL21P93-201 | ENST00000480465 | 489 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC233702.1-201 | ENST00000482905 | 502 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC087190.1-201 | ENST00000484462 | 480 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093591.1-201 | ENST00000491435 | 481 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL21P16-201 | ENST00000495531 | 483 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ARL2BPP4-201 | ENST00000506854 | 471 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC022447.1-201 | ENST00000515358 | 464 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | Vault.3-201 | ENST00000516676 | 95 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA18.6-201 | ENST00000516792 | 115 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PKIA-203 | ENST00000518467 | 588 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC022616.3-201 | ENST00000523940 | 148 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC087318.1-201 | ENST00000536786 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MGST1-215 | ENST00000540056 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL352984.1-201 | ENST00000556949 | 276 nt | TSL 3 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTCO3P13-201 | ENST00000577757 | 781 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR3167-201 | ENST00000579623 | 85 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | NBR2-204 | ENST00000587322 | 63 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC098826.3-201 | ENST00000603823 | 466 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL161798.1-201 | ENST00000604630 | 131 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC064872.1-201 | ENST00000604823 | 1072 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RN7SKP299-201 | ENST00000606679 | 301 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL627309.6-201 | ENST00000606857 | 840 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AP002360.4-201 | ENST00000606980 | 481 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DPY19L1-208 | ENST00000612226 | 607 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC010678.1-201 | ENST00000614118 | 713 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC008781.3-201 | ENST00000622826 | 335 nt | TSL 2 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC215522.3-201 | ENST00000635602 | 354 nt | TSL 5 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090582.1-201 | ENST00000636321 | 199 nt | BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LINC01419-201 | ENST00000522365 | 1521 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | OR4M1-202 | ENST00000641200 | 3493 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | UBE2L2-201 | ENST00000254302 | 429 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-960P-201 | ENST00000364056 | 120 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-188P-201 | ENST00000364207 | 107 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | Y_RNA.245-201 | ENST00000364493 | 95 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA75-201 | ENST00000384158 | 137 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-198P-201 | ENST00000384258 | 104 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-348P-201 | ENST00000384386 | 107 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC002456.1-201 | ENST00000415965 | 317 nt | TSL 5 BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL160272.1-201 | ENST00000421509 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTCO2P34-201 | ENST00000421994 | 607 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093843.1-201 | ENST00000424395 | 512 nt | TSL 2 BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC104651.1-201 | ENST00000427559 | 735 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | HMGB1P27-201 | ENST00000431429 | 603 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MTND4P32-201 | ENST00000437189 | 1237 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL23AP11-201 | ENST00000475260 | 469 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090525.1-201 | ENST00000479116 | 478 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC138853.1-201 | ENST00000503549 | 823 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL136537.1-201 | ENST00000508199 | 538 nt | TSL 3 BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC098799.2-201 | ENST00000509466 | 868 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-1220P-201 | ENST00000517126 | 108 nt | BASIC | 2.71 | □□□□□ -1.98 | | |