Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM43BQ6ZT52 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.59□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM43BQ6ZT52 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms