Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD8Q15843 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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