Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TWIST1Q15672 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms