Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SS18Q15532 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms