Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SPIDRQ14159 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms