Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM200BP0CF97 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms