Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CCDC47Q96A33 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CCDC47Q96A33 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CCDC47Q96A33 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CCDC47Q96A33 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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