Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRIM63Q969Q1 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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TRIM63Q969Q1 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRIM63Q969Q1 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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