Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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