Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CALCOCO2Q13137 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms