Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CPSF1Q10570 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms