Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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