Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4Q9P0V3 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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