Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CIPCQ9C0C6 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CIPCQ9C0C6 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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