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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU7-59P-201 | ENST00000459101 | 61 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC128713.1-201 | ENST00000471495 | 306 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TRBV1-201 | ENST00000476502 | 284 nt | BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC092666.1-201 | ENST00000492054 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 2.91 | □□□□□ -1.94 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | DISC1FP1-204 | ENST00000563681 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | LINC01002-202 | ENST00000631412 | 459 nt | TSL 5 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC096644.4-201 | ENST00000563417 | 2912 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTND5P30-201 | ENST00000452896 | 1731 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OR4K2-204 | ENST00000641885 | 8681 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ZNF736P9Y-201 | ENST00000439586 | 1345 nt | BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CBLL1-201 | ENST00000222597 | 2003 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.9 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SERPINI2-209 | ENST00000616363 | 1769 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | OFD1P6Y-202 | ENST00000451061 | 2724 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RNU6-851P-201 | ENST00000384565 | 107 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC103710.1-201 | ENST00000610003 | 901 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC092142.2-201 | ENST00000614642 | 354 nt | TSL 3 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC012593.1-211 | ENST00000625996 | 799 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | GYPB-216 | ENST00000638448 | 363 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL445259.1-201 | ENST00000587106 | 2984 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SYTL2-230 | ENST00000634661 | 6672 nt | TSL 5 BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MTND5P33-201 | ENST00000571250 | 1450 nt | BASIC | 2.89 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | IL33-202 | ENST00000417746 | 2327 nt | TSL 2 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC104454.1-201 | ENST00000421341 | 1401 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORA9.2-201 | ENST00000365361 | 133 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MIR524-201 | ENST00000385242 | 87 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC098592.1-201 | ENST00000419352 | 333 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | DNAJA1P2-201 | ENST00000421360 | 1197 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RPS20P5-201 | ENST00000434808 | 360 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | RSU1P2-202 | ENST00000437884 | 485 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL160287.1-201 | ENST00000455612 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORD109B-201 | ENST00000458961 | 67 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORD109A-201 | ENST00000459128 | 67 nt | BASIC | 2.88 | □□□□□ -1.95 | | |