Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHCHD4Q8N4Q1 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms