Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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RTL8BQ17RB0 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RTL8BQ17RB0 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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