Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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SCN9AQ15858 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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SCN9AQ15858 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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SCN9AQ15858 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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SCN9AQ15858 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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SCN9AQ15858 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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SCN9AQ15858 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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SCN9AQ15858 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SCN9AQ15858 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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