Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NEDD8Q15843 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NEDD8Q15843 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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