Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
UBE4AQ14139 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms