Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KRR1Q13601 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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