Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HDAC1Q13547 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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