Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NME3Q13232 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NME3Q13232 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms