Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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ANKRD39Q53RE8 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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ANKRD39Q53RE8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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ANKRD39Q53RE8 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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ANKRD39Q53RE8 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ANKRD39Q53RE8 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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