Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ZIC1Q15915 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ZIC1Q15915 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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