Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHHQ15465 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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