Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SHPRHQ149N8 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHPRHQ149N8 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms