Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SMAD4Q13485 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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