Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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CBX3Q13185 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CBX3Q13185 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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