Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CHAF1BQ13112 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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