Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms