Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PSDA5PKW4 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PSDA5PKW4 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms