Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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FOXQ1Q9C009 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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FOXQ1Q9C009 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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FOXQ1Q9C009 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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FOXQ1Q9C009 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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FOXQ1Q9C009 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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FOXQ1Q9C009 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXQ1Q9C009 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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