Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
LRRIQ1Q96JM4 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms