Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGA3Q16281 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms