Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZFHX3Q15911 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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