Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SS18Q15532 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
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SS18Q15532 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SS18Q15532 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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